? ? ? ?據近日發表在《自然》雜誌上的論(lùn)文,美國加州大學聖地亞哥分校和斯克利(lì)普斯研究所聯合開發了一種名為“Freyja”的算法,用於在早期檢(jiǎn)測廢水中的新冠(guàn)病毒變異株,隻需兩茶(chá)匙未經處理的汙水,就可準確測定新冠(guàn)病毒變異株。
斯克利普斯研究所研究人員開發了一個(gè)“條形碼”庫,可根(gēn)據每個變(biàn)異株特(tè)有的短RNA片段來識別新冠(guàn)病毒變異株,並編寫了一種新(xīn)算(suàn)法,通(tōng)過篩選廢水中的大量(liàng)遺傳信息來匹配這些條形碼。由此生成的免費程序Freyja,已經被美國公共衛生機構廣泛用於廢水(shuǐ)監(jiān)測。
研究(jiū)人員表示,在實(shí)驗室對廢(fèi)水樣(yàng)本(běn)進行測序後,隻需運行Freyja,20秒就可得到結果。當研(yán)究人員將Freyja應用於廢水樣本並(bìng)將結果與聖地亞哥市的臨床數(shù)據(jù)進行比較時,他們發現該工具(jù)在臨(lín)床報告前14天就在廢水(shuǐ)中檢測出了“值得關切的變(biàn)異株”,包括阿爾法、德爾塔和奧密克戎(róng)變異株。
2021年7月27日,研究人(rén)員在(zài)加州大學聖地亞哥分校的廢水中檢測到繆變異株9(B.1.621),這是在(zài)校園*臨床檢(jiǎn)測的4周前檢測出來的(de)。同年11月27日,該(gāi)團隊還在聖地亞哥(gē)*臨床報告前11天檢測到廢水中的奧密克戎(róng)變異株(zhū)。
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